导读
相关研究发表于《G3:基因
白肉灵芝(吴清平团队供图)
近日,完成中国工程院院士、白肉广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了白肉灵芝的灵芝全基因组测序。据悉,基因这是组测世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,完成基因组,白肉遗传学》。灵芝
白肉灵芝是基因在中国发现的灵芝科一新种,具有多种药理活性。组测作为我国具有鲜明地域特色的完成野生资源,白肉灵芝目前已成为科技扶贫和带动一方经济发展的白肉重要资源,在中国西南地区广泛种植。灵芝但由于缺乏参考基因组,基因其遗传研究受到了阻碍。组测
研究人员从一个单核菌株中提取了高质量的DNA,并基于Illumina和Nanopore平台组装完成第一个白肉灵芝全基因组。组装的基因组大小为50.05Mb,N50为3.06Mb,预测到78206条编码序列和13390个基因。
此外,研究人员分析了白肉灵芝和灵芝之间次级代谢产物(萜类化合物)的功能基因的差异。研究发现,与灵芝相比,白肉灵芝具有更多与萜类化合物合成相关的基因,这可能是它们表现出不同生物活性的原因之一。
据吴清平团队成员胡惠萍介绍,白肉灵芝基因组是目前组装质量最好的灵芝属物种。该成果为今后特定物种的高原适应性深层研究奠定了基础。(记者朱汉斌通讯员李诚斌)
大连医科大学附属第一医院 |
首都医科大学附属北京朝阳医院 |
四川大学华西医院 |
重庆医科大学附属第一医院 |
北京医院 |
中国医学科学院阜外医院 |
吉林大学第二医院 |
河南科技大学第一附属医院 |
山西医科大学第一医院 |
中山大学附属第一医院 |
承德医学院附属医院 |
山东省立医院 |
浙江大学医学院附属邵逸夫医院 |
天津医科大学总医院 |
海军军医大学附属长海医院 |
温州医学院附属第一医院 |
深圳市人民医院 |
空军军医大学西京医院 |
蚌埠医学院第一附属医院 |
深圳市第六人民医院(南山医院) |
上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
青岛大学附属医院 |
北部战区总医院 |
济宁医学院附属医院 |
福建医科大学附属第一医院 |
烟台市烟台山医院 |
哈尔滨医科大学附属第二医院 |
昆明医科大学第一附属医院 |
山东淄博市第一医院 |
南京鼓楼医院 |
东莞市人民医院 |
新疆医科大学第一附属医院 |
北京京煤集团总医院 |
首都医科大学附属北京潞河医院 |
新疆维吾尔自治区人民医院 |
中南大学湘雅医院 |
广州医科大学附属第一医院 |
北京协和医院 |
江阴市人民医院 |
河北医科大学第二医院 |
中国人民解放军总医院第六医学中心 |
沈阳医学院附属中心医院(奉天医院) |
天津市宁河区医院 |
四川省人民医院 |
邯郸市第一医院 |
潍坊呼吸病医院 |
云南省第一人民医院 |
山西省人民医院 |
内蒙古医学院第三附属医院 |
河北衡水哈励逊国际和平医院 |
海南省人民医院 |
青海省人民医院 |
贵州省人民医院 |
华北理工大学附属医院 |
福建省泉州市第一医院 |
锦州医科大学附属第一医院 |
首都医科大学附属复兴医院 |
淄博市立医院 |
山西省太原市中心医院 |
上海市肺科医院 |
新疆医科大学第三附属医院 |
山西医学科学院山西大医院 |
天津市海河医院 |
战略支援部队特色医学中心 |
河北医科大学第三医院 |
北京积水潭医院 |
无锡市人民医院 |
新疆维吾尔自治区中医医院 |
安徽省胸科医院 |
空军军医大学唐都医院 |
广东省人民医院 |
复旦大学附属华山医院 |
首都医科大学附属北京安贞医院 |
中国人民解放军总医院第一医学中心 |
宁夏医科大学总医院 |
河南省焦作市第二人民医院 |
首都医科大学附属北京同仁医院 |
南方医科大学南方医院 |
南昌大学第二附属医院 |
北京市大兴区人民医院 |
上海交通大学医学院附属新华医院 |
内蒙古自治区人民医院 |
南昌大学第一附属医院 |
中国医科大学附属盛京医院 |
西安交通大学第一附属医院 |
河北医科大学第一医院 |
广西壮族自治区人民医院 |
北京市顺义区医院 |
复旦大学附属中山医院 |
中山大学附属第三医院 |
粤北人民医院 |
首都医科大学附属北京世纪坛医院 |
中国科学院大学附属北京怀柔医院 |
首都医科大学附属北京儿童医院 |
天津市第一中心医院 |
华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
兰州大学第二附属医院 |
西藏自治区第二人民医院 |
唐山工人医院 |
中日友好医院 |